Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms