Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIC2Q96JB3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIC2Q96JB3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms