Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BORCS6Q96GS4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms