Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINGO1Q96FE5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINGO1Q96FE5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms