Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms