Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms