Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms