Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms