Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUFY3Q7L099 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUFY3Q7L099 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms