Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIG3Q6UXM1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.4 ms