Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VIRMAQ69YN4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms