Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms