Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP170Q5SW79 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms