Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
USF2Q15853 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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