Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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