Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms