Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ALX1Q15699 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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