Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms