Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABEP1Q15276 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABEP1Q15276 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms