Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
R3HDM1Q15032 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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