Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms