Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 LINC00648-204ENST00000557749 443 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 LLPH-202ENST00000446587 1177 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms