Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XRCC4Q13426 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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