Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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