Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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