Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN3Q13064 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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