Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK2Q13002 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms