Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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