Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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