Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC1Q08554 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms