Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms