Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG1Q06432 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms