Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms