Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CREMQ03060 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREMQ03060 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREMQ03060 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms