Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms