Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMF1P82094 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms