Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SIM1P81133 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIM1P81133 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms