Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UFM1P61960 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UFM1P61960 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms