Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC13P55735 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC13P55735 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC13P55735 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC13P55735 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms