Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAD23BP54727 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms