Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2A2P52657 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms