Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD4P46934 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms