Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms