Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCGF2P35227 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms