Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA3P32297 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms