Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms