Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB2P29033 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms