Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ME2P23368 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ME2P23368 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms