Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms