Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP2AP11388 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms